Nicis Institute richt zich op het versterken van de sociale en economische kracht van steden door de combinatie van wetenschappelijk onderzoek, kennisdeling en opleiding. Het eigen wetenschappelijk onderzoeksprogramma vormt de basis voor masteropleidingen, bijeenkomsten en publicaties. Nicis Institute kijkt daarbij ook naar grootstedelijke ontwikkelingen in Europa. Het Kenniscentrum Grote Steden maakt er sinds 1 januari 2007 onderdeel van uit. De kennisbank van Nicis Institute bevat een groot aantal onderzoeken en praktijkvoorbeelden, gerangschikt op thema.